MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes Alab49 chromosome

Total Repeats: 38976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017596	TTG	2	6	3	8	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017596	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017596	T	6	6	24	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017596	A	6	6	42	47	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017596	ATTT	2	8	123	130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017596	ACTA	2	8	149	156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017596	AAG	2	6	219	224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017596	T	6	6	253	258	0 %	100 %	0 %	0 %	386361882
9	NC_017596	T	6	6	312	317	0 %	100 %	0 %	0 %	386361882
10	NC_017596	ATG	2	6	322	327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361882
11	NC_017596	A	7	7	397	403	100 %	0 %	0 %	0 %	386361882
12	NC_017596	CTG	2	6	424	429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361882
13	NC_017596	GAA	2	6	474	479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361882
14	NC_017596	ATCA	2	8	510	517	50 %	25 %	0 %	25 %	386361882
15	NC_017596	AGC	2	6	526	531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361882
16	NC_017596	TGC	2	6	626	631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361882
17	NC_017596	TTA	2	6	714	719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361882
18	NC_017596	AT	3	6	770	775	50 %	50 %	0 %	0 %	386361882
19	NC_017596	TTA	2	6	790	795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361882
20	NC_017596	GAAA	2	8	839	846	75 %	0 %	25 %	0 %	386361882
21	NC_017596	TGA	2	6	875	880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361882
22	NC_017596	A	7	7	897	903	100 %	0 %	0 %	0 %	386361882
23	NC_017596	CT	3	6	906	911	0 %	50 %	0 %	50 %	386361882
24	NC_017596	AAG	2	6	919	924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361882
25	NC_017596	ATA	3	9	952	960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386361882
26	NC_017596	ACAA	2	8	961	968	75 %	0 %	0 %	25 %	386361882
27	NC_017596	ATC	2	6	997	1002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361882
28	NC_017596	AGA	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361882
29	NC_017596	CCT	2	6	1065	1070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386361882
30	NC_017596	CAAA	2	8	1226	1233	75 %	0 %	0 %	25 %	386361882
31	NC_017596	TGC	2	6	1256	1261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361882
32	NC_017596	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361882
33	NC_017596	CTA	2	6	1375	1380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361882
34	NC_017596	TGG	2	6	1475	1480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386361882
35	NC_017596	TAA	2	6	1511	1516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386361882
36	NC_017596	A	6	6	1571	1576	100 %	0 %	0 %	0 %	386361882
37	NC_017596	AAC	2	6	1637	1642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017596	TC	3	6	1658	1663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017596	TTTA	2	8	1665	1672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017596	TA	3	6	1684	1689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017596	CTA	4	12	1698	1709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017596	TTA	3	9	1711	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017596	TTA	2	6	1723	1728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017596	ATT	2	6	1770	1775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361883
45	NC_017596	TCA	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361883
46	NC_017596	GTAA	2	8	1921	1928	50 %	25 %	25 %	0 %	386361883
47	NC_017596	TTA	2	6	1969	1974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361883
48	NC_017596	T	7	7	1983	1989	0 %	100 %	0 %	0 %	386361883
49	NC_017596	ATT	2	6	1996	2001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361883
50	NC_017596	AAC	2	6	2042	2047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361883
51	NC_017596	GTT	2	6	2053	2058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361883
52	NC_017596	AAG	2	6	2123	2128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361883
53	NC_017596	ATT	2	6	2163	2168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361883
54	NC_017596	TAT	2	6	2175	2180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361883
55	NC_017596	GTC	2	6	2216	2221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361883
56	NC_017596	GACT	2	8	2280	2287	25 %	25 %	25 %	25 %	386361883
57	NC_017596	CAG	2	6	2330	2335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361883
58	NC_017596	GA	3	6	2367	2372	50 %	0 %	50 %	0 %	386361883
59	NC_017596	CAG	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361883
60	NC_017596	GAT	2	6	2392	2397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361883
61	NC_017596	TTA	2	6	2506	2511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361883
62	NC_017596	GTT	2	6	2533	2538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361883
63	NC_017596	GGTAA	2	10	2668	2677	40 %	20 %	40 %	0 %	386361883
64	NC_017596	AGTC	2	8	2698	2705	25 %	25 %	25 %	25 %	386361883
65	NC_017596	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361883
66	NC_017596	AATT	2	8	2852	2859	50 %	50 %	0 %	0 %	386361883
67	NC_017596	TAAG	2	8	2878	2885	50 %	25 %	25 %	0 %	386361883
68	NC_017596	T	7	7	2906	2912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017596	TTA	2	6	2914	2919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017596	ATA	2	6	2932	2937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017596	TGAAA	2	10	2978	2987	60 %	20 %	20 %	0 %	386361884
72	NC_017596	A	6	6	2985	2990	100 %	0 %	0 %	0 %	386361884
73	NC_017596	ATG	2	6	3099	3104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361884
74	NC_017596	A	7	7	3131	3137	100 %	0 %	0 %	0 %	386361884
75	NC_017596	TAAA	2	8	3162	3169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017596	A	6	6	3204	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017596	AGA	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017596	AAT	2	6	3333	3338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017596	TCT	2	6	3405	3410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017596	TCT	2	6	3427	3432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017596	T	6	6	3434	3439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017596	TAA	2	6	3444	3449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017596	TTGA	2	8	3452	3459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017596	CAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361885
85	NC_017596	GCT	2	6	3566	3571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361885
86	NC_017596	TGGTA	2	10	3604	3613	20 %	40 %	40 %	0 %	386361885
87	NC_017596	A	7	7	3662	3668	100 %	0 %	0 %	0 %	386361885
88	NC_017596	AAAT	2	8	3742	3749	75 %	25 %	0 %	0 %	386361885
89	NC_017596	TGA	3	9	3802	3810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361885
90	NC_017596	TCAA	2	8	3908	3915	50 %	25 %	0 %	25 %	386361885
91	NC_017596	A	6	6	3936	3941	100 %	0 %	0 %	0 %	386361885
92	NC_017596	GTT	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361885
93	NC_017596	AAC	2	6	4087	4092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361885
94	NC_017596	CAAA	2	8	4162	4169	75 %	0 %	0 %	25 %	386361885
95	NC_017596	AGT	2	6	4201	4206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361885
96	NC_017596	AGA	3	9	4225	4233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361885
97	NC_017596	AGA	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361885
98	NC_017596	AGC	2	6	4318	4323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361885
99	NC_017596	ATC	2	6	4326	4331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361885
100	NC_017596	CAG	2	6	4356	4361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361885
101	NC_017596	GCT	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386361885
102	NC_017596	TAT	2	6	4423	4428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361885
103	NC_017596	ATG	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361885
104	NC_017596	AAG	2	6	4515	4520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361885
105	NC_017596	GAA	2	6	4535	4540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361885
106	NC_017596	TGT	2	6	4552	4557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361885
107	NC_017596	CAT	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361885
108	NC_017596	GAA	2	6	4625	4630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017596	TTG	2	6	4680	4685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386361886
110	NC_017596	A	6	6	4713	4718	100 %	0 %	0 %	0 %	386361886
111	NC_017596	GAT	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361886
112	NC_017596	TTA	2	6	4821	4826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361886
113	NC_017596	CTA	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361886
114	NC_017596	AAT	2	6	4868	4873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386361886
115	NC_017596	CTA	2	6	4903	4908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386361886
116	NC_017596	ATG	2	6	4941	4946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361886
117	NC_017596	TTACGT	2	12	4970	4981	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386361886
118	NC_017596	CAG	2	6	4992	4997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361886
119	NC_017596	GAC	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386361886
120	NC_017596	TTA	2	6	5097	5102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361886
121	NC_017596	ATA	2	6	5133	5138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386361886
122	NC_017596	TTTA	2	8	5184	5191	25 %	75 %	0 %	0 %	386361886
123	NC_017596	A	6	6	5208	5213	100 %	0 %	0 %	0 %	386361886
124	NC_017596	ATT	2	6	5253	5258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017596	ACC	2	6	5299	5304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017596	GAT	2	6	5374	5379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361887
127	NC_017596	A	9	9	5381	5389	100 %	0 %	0 %	0 %	386361887
128	NC_017596	TGA	2	6	5454	5459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361887
129	NC_017596	T	6	6	5476	5481	0 %	100 %	0 %	0 %	386361887
130	NC_017596	TGA	2	6	5705	5710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361887
131	NC_017596	T	6	6	5821	5826	0 %	100 %	0 %	0 %	386361887
132	NC_017596	GAT	2	6	5830	5835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361887
133	NC_017596	AAC	2	6	5882	5887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386361887
134	NC_017596	TTA	2	6	5900	5905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361887
135	NC_017596	GAT	2	6	5989	5994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386361887
136	NC_017596	A	6	6	5995	6000	100 %	0 %	0 %	0 %	386361887
137	NC_017596	AGA	2	6	6009	6014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386361887
138	NC_017596	A	6	6	6030	6035	100 %	0 %	0 %	0 %	386361887
139	NC_017596	ATT	2	6	6072	6077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386361887
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453	NC_017596	TA	3	6	18896	18901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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